保生大帝是台灣民間崇拜的醫藥神，也是泉州同安縣移民的鄉土神；據說保生大帝自幼即非常聰穎，能過目不忘，且在醫藥方面相當有天賦，終生茹素未娶。曾擔任官員，後來跟隨仙人學道，煉丹濟世。
保生大帝生前活動地點主要在同安白礁、青礁、安溪石門等地，這些地方均築有廟宇奉祀。相傳保生大帝精通醫術且曾在中國福建省同安縣花橋義診，因此有花橋公之名。宋代以來，歷朝皆對保生大帝有數次加封，重要的封號有二，其一是於宋孝宗乾道年間敕封為「大道真人」，二是明仁宗洪熙年間敕封「恩主昊天金闕御史慈濟醫靈妙道真君萬壽無極保生大帝」。
據《台灣縣志》記載：「保生大帝長大後，專於醫藥，以活人為心，按病投藥遠近皆以為神。」因此民間就有許多他習醫的傳說，留傳最廣的傳說就指出他十七歲時，有一天在海邊賞月，突然出現了一位神仙，由天而降，帶他駕著祥雲前往崑崙山，拜見西王母，西王母見他聰穎過人，懷有一顆濟世之心，因此就傳以神方濟世和驅魔逐邪的工夫，並贈送他一本珍貴的醫書。他返家後潛心修習醫術，幾年後，他便外出遊歷名川、大山；印証所學醫術，所以能有妙手回春之醫術。
宋仁宗明道元年〈西元一零三二年〉，福建漳、泉一帶旱災嚴重，瘟疫橫行，保生大帝出錢出力，到處脤災，而且亦帶著學生們下鄉為鄉民們醫治疾病，他們借住在花轎亭客棧，免費行醫救人無數，幾年後，鄉人感念他的義舉，便在花轎亭蓋了一座「真人宮」，表示對這位偉人的敬意，也因為如此，後人也尊稱他為「花轎公」。
相傳宋神宗祥符七年，保生大帝曾在河南一帶行醫，有一回在一座樹林中，見到了一副骨骸，少了一根左腿骨，於是他就取了一段柳條，置於骨骸左腿之處，念了咒語，這副枯骨就頓時成為一個童子的模樣，跟隨他到處行醫。
有一天他們竟然在路上碰到這個童子原本的主人，名叫江仙官，江仙官相當驚訝！因為在幾個月前，他明明見到自己的童僕被大老虎叼走，此時他的這位童僕居然死後復生。他不相信保生大帝能令死人復生，於是大帝將童僕再度變回枯骨，江仙官佩服的五體投地，於是棄官從醫，追隨保生大帝四處行醫，這也就是後來民間流傳「神方活骨，江張從師」由來。
相傳明成祖年間，皇后患有乳疾，求訪天下名醫莫救，突有道士自稱住白礁鄉名吳夲，自稱能醫治皇后重病，並言能以絲線診脈。成祖先以絲線繫於皇后玉鐲、貓身，皆被真人識破，成祖驚異，乃命內侍繫絲線於皇后手腕，斷為乳疾，並隔屏指示施以針灸，乳疾頓消。成祖欲賜予官爵財寶，皆辭不受，騎鶴而去。皇后感其恩德，乃立國母獅於福建白礁慈濟宮廟庭之內。又一說是文皇后生病後夢見有一道人牽紅絲線為其切脈，後來用艾條灸之，醒來之後已經痊癒。事後明成祖遣人尋找，在白礁發現吳真人的神像，為了感恩而贈與白礁慈濟宮「國母獅」。
所以，保生大帝一直是台灣民間崇拜的醫藥神，而福建一帶祭拜保生大帝的廟宇也不少，相關神績眾多，例如如保生大帝「騎鶴退洪水」、「救朱元璋於陽湖」…等神蹟，不勝枚舉，由於太靈驗，福建同安縣人就把保生大帝奉為主神；早年，每當有福建移民渡海來台，就會攜帶他們所奉祀的保生大帝，或迎奉分身，在台灣各處建廟奉祀保生大帝，據統計全台保生大帝的主廟就高達140所以上。
奉祀保生大帝的廟宇，大多還供奉有中壇元帥、溫康馬趙四大元帥、江仙官、張聖者、三十六官將、黑虎將軍等神祇，均被視為護法或部將 • 由於保生大帝乃醫藥神，因而廟宇中都設有藥籤，以供信徒卜求。
全台灣以保生大帝為主祀神的廟宇非常多，多集中在台南、高雄。最早的是臺南新化的保生大帝宮，可能始於荷蘭人時期，分靈最多者以臺南學甲慈濟宮。知名者，北部以台北市大龍峒保安宮最著名，每年舉辦保生文化祭，是台灣重要的民俗藝術活動；南部以臺南縣學甲慈濟宮最馳名，所舉辦「上白礁」是南部保生大帝信仰中，重要的宗教盛事之一，廟內的葉王交趾陶更是重要文物。
民間也有不具廟宇而採用輪祀的保生大帝，例如台北淡水、三芝九角頭保生大帝；也有以單一姓氏為主的台北西河林姓十一角頭保生大帝、台北吳姓六角頭保生大帝，信仰模式均為鄰近地區的同姓人士劃分地域以輪流祭拜保生大帝。
在所奉祀保生大帝的廟宇之中，最特殊的一點，就是廟中都設有藥籤。因此對病人或病人家屬來說，到保生大帝的廟宇來，除了可祈求神明保祐外，也可以來求藥方，再到中藥房抓藥回去給病人吃。
這種藥籤，大致上來說和一般抽詩籤問吉凶的方式並無不同，但是抽藥籤之前除了祈禱外，還必須將病情陳述一番，讓保生大帝知道後，再從籤筒中抽竹籤一支，並擲筊來決定是否為適合之藥籤。由於信仰上的治療，或多或少對病情有有所助益，因此數百年來保生大帝的信仰，歷久不衰，原因在此。
